102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2996 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  58.14 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  55.42 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1796  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  49.41 
 
 
93 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  44.44 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  48.1 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  52.63 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  46.84 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  49.33 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  44.3 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  40.96 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  45.35 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  46.84 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  43.75 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  48.44 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  41.86 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  42.5 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  44.3 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  43.53 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  44.71 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  43.02 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  44.87 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  45.57 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  45.57 
 
 
188 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  44.3 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  41.25 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  43.84 
 
 
83 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  42.31 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  42.31 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  38.82 
 
 
88 aa  57.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  41.03 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  46.15 
 
 
453 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  39.53 
 
 
86 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  42.17 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  40.96 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  39.29 
 
 
88 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  36.25 
 
 
194 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  40.51 
 
 
88 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  42.17 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  37.66 
 
 
1422 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  42.5 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  42.5 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  34.52 
 
 
1428 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  37.18 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  37.08 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  42.05 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  42.5 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  42.5 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  36.36 
 
 
1447 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  42.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  39.47 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  42.5 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  42.5 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  42.65 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  44.59 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  41.25 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4083  PAAR  41.43 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  33.68 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  38.37 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  35.56 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  38.64 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0004  PAAR repeat-containing protein  36.92 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0248137  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  34.18 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  36.14 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  35.56 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  33.73 
 
 
1437 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  37.66 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  35 
 
 
1527 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.9 
 
 
1446 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  34.85 
 
 
466 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  27.91 
 
 
1423 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6532  PAAR repeat-containing protein  46.94 
 
 
52 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 
1381 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 
1541 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 
1541 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 
1541 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  32.89 
 
 
1541 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  32.89 
 
 
1541 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 
1541 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  33.71 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  28.92 
 
 
1475 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  31.67 
 
 
540 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  28.92 
 
 
1457 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  31.25 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  35.71 
 
 
592 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  30.77 
 
 
1494 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 
1494 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  36.07 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 
1487 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.792751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>