More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2938 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
279 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  57.04 
 
 
281 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  55.8 
 
 
277 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  55.27 
 
 
277 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  51.82 
 
 
279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  42.09 
 
 
279 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  44.77 
 
 
279 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  48.02 
 
 
178 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  50.93 
 
 
164 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
300 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 
300 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
300 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
300 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 
300 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
300 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  28.72 
 
 
310 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  27.55 
 
 
302 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  32.86 
 
 
294 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 
287 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  27.85 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 
290 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
289 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  28.18 
 
 
288 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  27.64 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  27.84 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  27.24 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  25.43 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  27.84 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
281 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  30.42 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  25.56 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  25.56 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  25.56 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  28.73 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  25.56 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  25.56 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  27.8 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  25.93 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  27.68 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  27.34 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  28.77 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>