More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2927 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  91.55 
 
 
527 aa  966    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  91.32 
 
 
527 aa  973    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
530 aa  1052    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  91.32 
 
 
527 aa  973    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.46 
 
 
514 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.55 
 
 
504 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.35 
 
 
527 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  57.31 
 
 
503 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.65 
 
 
539 aa  428  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.37 
 
 
540 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.42 
 
 
539 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.02 
 
 
526 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.69 
 
 
536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.27 
 
 
538 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.44 
 
 
535 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.76 
 
 
543 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 
535 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  41.9 
 
 
529 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 
535 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  41.17 
 
 
539 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 
542 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.49 
 
 
542 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.7 
 
 
529 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 
542 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 
542 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.92 
 
 
527 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.96 
 
 
526 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.18 
 
 
517 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 
516 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.32 
 
 
516 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 
516 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.92 
 
 
535 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.81 
 
 
519 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  39.72 
 
 
519 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  39.07 
 
 
534 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.73 
 
 
516 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  39.32 
 
 
499 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.41 
 
 
523 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  36.67 
 
 
528 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 
524 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.88 
 
 
532 aa  303  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.04 
 
 
526 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 
516 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 
528 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 
529 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 
528 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 
535 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 
528 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 
528 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 
528 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 
528 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 
523 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.59 
 
 
524 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.68 
 
 
526 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.01 
 
 
524 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 
524 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 
524 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 
525 aa  288  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 
515 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 
524 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 
520 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 
524 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.33 
 
 
537 aa  286  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.53 
 
 
515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.61 
 
 
523 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.01 
 
 
524 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.92 
 
 
532 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.43 
 
 
529 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.21 
 
 
525 aa  280  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.43 
 
 
529 aa  279  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.05 
 
 
532 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 
517 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 
531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.64 
 
 
517 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.94 
 
 
521 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 
530 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.62 
 
 
525 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 
525 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 
525 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 
528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.14 
 
 
529 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.93 
 
 
530 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.27 
 
 
528 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.68 
 
 
530 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 
543 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 
516 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 
528 aa  263  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 
506 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 
522 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 
536 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 
511 aa  260  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  32.85 
 
 
508 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 
532 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
524 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  33.53 
 
 
511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 
532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 
532 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  30.91 
 
 
529 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 
529 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>