More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2888 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  76.69 
 
 
601 aa  874    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  89.02 
 
 
610 aa  1093    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0955  putative two-component regulator histidine sensor kinase  66.89 
 
 
602 aa  805    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
606 aa  1229    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0633  MmoS, putative  66.89 
 
 
602 aa  803    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  89.02 
 
 
610 aa  1093    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  66.72 
 
 
611 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  66.23 
 
 
602 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  86.96 
 
 
603 aa  1058    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  89.02 
 
 
610 aa  1093    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  90.59 
 
 
606 aa  1090    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
608 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
613 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
607 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4735  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 
594 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
663 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
664 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1120 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.09 
 
 
1331 aa  171  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
1433 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  31.68 
 
 
2051 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  31.46 
 
 
742 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  29.85 
 
 
676 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 
1029 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  29.06 
 
 
882 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
846 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
781 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
524 aa  164  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
865 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  31.57 
 
 
1364 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
641 aa  161  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
813 aa  161  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1154 aa  160  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
806 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  28.54 
 
 
1060 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
913 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
768 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
768 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
1631 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  30.24 
 
 
578 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  28.83 
 
 
1026 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
785 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.53 
 
 
509 aa  158  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
654 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
768 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
768 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  30.07 
 
 
667 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  30.38 
 
 
853 aa  157  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
737 aa  157  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  27.64 
 
 
547 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1261 aa  156  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
781 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 
572 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
770 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
922 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  29.72 
 
 
630 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
1791 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  29.77 
 
 
945 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
1305 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1323 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1070 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  29.1 
 
 
588 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1603 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
1767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
1767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  29.47 
 
 
630 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
672 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 
1113 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  28.9 
 
 
1407 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1146 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
770 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1011 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
656 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  25.11 
 
 
736 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
799 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
877 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
860 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
708 aa  154  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  32.02 
 
 
550 aa  153  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.99 
 
 
763 aa  153  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 
1771 aa  153  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  30.65 
 
 
710 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  29.74 
 
 
1287 aa  153  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
695 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
662 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
957 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
873 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
784 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1363 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  27.82 
 
 
603 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
1767 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 
815 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  29.46 
 
 
1765 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  29.16 
 
 
1028 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
666 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
1075 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
597 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
666 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1611 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
1350 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>