More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2814 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  100 
 
 
155 aa  324  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  72.08 
 
 
167 aa  239  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  59.86 
 
 
154 aa  194  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  59.86 
 
 
154 aa  194  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10843  deaminase  58.47 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.52974e-17  hitchhiker  0.000000121156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.22 
 
 
155 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  42.95 
 
 
157 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.86 
 
 
158 aa  130  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.18 
 
 
150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  38.16 
 
 
151 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  37.5 
 
 
151 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.38 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.41 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  40 
 
 
153 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
158 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  36.49 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  36 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.49 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.6 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.26 
 
 
159 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.74 
 
 
160 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.6 
 
 
155 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.86 
 
 
183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.33 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  36.91 
 
 
163 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36 
 
 
154 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.6 
 
 
157 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.35 
 
 
163 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.46 
 
 
157 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.52 
 
 
158 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.42 
 
 
160 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.51 
 
 
223 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  37.09 
 
 
161 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.3 
 
 
155 aa  101  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
153 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  39.74 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.62 
 
 
190 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  42.24 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.69 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.55 
 
 
214 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  32.89 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.87 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.05 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.67 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.16 
 
 
156 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.61 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  40.35 
 
 
186 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.42 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.71 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.38 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.61 
 
 
211 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.32 
 
 
143 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.43 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.11 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  43.16 
 
 
159 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.74 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.35 
 
 
147 aa  87  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  42.98 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.94 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  43.16 
 
 
193 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.62 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  43.62 
 
 
182 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.94 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.24 
 
 
161 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.94 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  44.09 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.94 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.19 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  43.62 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.74 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1170  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.74 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.358945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  40.86 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.84 
 
 
475 aa  80.9  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.05 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  37.5 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.18 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0184  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  40.86 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.57 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  42.55 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.78 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  40.86 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3870  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.3 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0619986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  38.04 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  38.95 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  36.84 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.39 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.23 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 
181 aa  77  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.3 
 
 
176 aa  77  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.04 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.43 
 
 
150 aa  77  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  44.74 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  38.3 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  44.74 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  34.91 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>