More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2789 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  100 
 
 		 308 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  72.82 
 
 		 294 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  61.13 
 
 		 313 aa  343  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  59.57 
 
 		 312 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  63.21 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  62.9 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  62.54 
 
 		 306 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  55.4 
 
 		 291 aa  305  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  46.69 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  44.52 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  48.12 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  41.94 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  37.4 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  35.47 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  35.56 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  34.11 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  35.09 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  30.85 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  37.21 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  37.99 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  38.82 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  33.85 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  37.36 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  33.05 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  27.52 
 
 		 728 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  34.36 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  34.4 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  38.67 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  36.21 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.46 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.37 
 
 		 751 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.37 
 
 		 728 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  36.67 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  39.77 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  32.68 
 
 		 410 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.81 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  40.35 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.02 
 
 		 728 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  32.97 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  26.6 
 
 		 727 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.8 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  35.96 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.57 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  32.28 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  33.13 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  31.16 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  31.36 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  35.96 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  30.77 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  32.82 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  29.59 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  35.68 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.08 
 
 		 754 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  32.4 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  28.95 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  25.57 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  32.96 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.08 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  31.25 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  32.47 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  35.96 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  29.18 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  34.38 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  35.39 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  28.91 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  27.98 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  33.33 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  24.05 
 
 		 760 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  28.46 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  25.19 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.95 
 
 		 740 aa  79  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.4 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  27.56 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  27.82 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.33 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  37.29 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  28.33 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  26.15 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  30 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  28.04 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  28.04 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  28.04 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.34 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  26.39 
 
 		 751 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  27.09 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  28.29 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  25.22 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  28.94 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  32.39 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.98 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  25.75 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  26.67 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.64 
 
 		 741 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  28.98 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  25.18 
 
 		 740 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.98 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  28.98 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  24.81 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  29.28 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  32.96 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>