More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2780 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  68.8 
 
 
560 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  100 
 
 
576 aa  1188    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  70.05 
 
 
560 aa  823    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  39.32 
 
 
620 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  38.32 
 
 
606 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  38.38 
 
 
583 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  38.38 
 
 
583 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  37.02 
 
 
582 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  38.25 
 
 
543 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  33.22 
 
 
574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  35.29 
 
 
542 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  32.86 
 
 
616 aa  247  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.47 
 
 
569 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  32.14 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  32.81 
 
 
575 aa  230  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 
545 aa  227  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.51 
 
 
542 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.81 
 
 
603 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.79 
 
 
553 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.7 
 
 
596 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.07 
 
 
556 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.2 
 
 
532 aa  210  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  30.56 
 
 
613 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  31.02 
 
 
608 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
564 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.57 
 
 
530 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.36 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.52 
 
 
560 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.84 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.16 
 
 
535 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  32.52 
 
 
574 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  30.04 
 
 
564 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  29.5 
 
 
543 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  30.26 
 
 
550 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.83 
 
 
555 aa  192  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  31.76 
 
 
553 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
569 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  29.91 
 
 
550 aa  190  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  31.86 
 
 
601 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  26.89 
 
 
558 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 
584 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  28.57 
 
 
580 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  29.88 
 
 
573 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  32.54 
 
 
538 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.46 
 
 
557 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.98 
 
 
560 aa  183  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  28.7 
 
 
573 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.2 
 
 
579 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.8 
 
 
540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.52 
 
 
547 aa  181  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.32 
 
 
539 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  30.48 
 
 
565 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.75 
 
 
543 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  30.02 
 
 
589 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.98 
 
 
564 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.25 
 
 
564 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.66 
 
 
576 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.66 
 
 
538 aa  177  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.47 
 
 
544 aa  176  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  29.16 
 
 
543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.96 
 
 
544 aa  173  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  27.77 
 
 
580 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.93 
 
 
569 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  30.99 
 
 
539 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.95 
 
 
522 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.64 
 
 
548 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.64 
 
 
548 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.64 
 
 
548 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  24.77 
 
 
526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  28.37 
 
 
568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  26.74 
 
 
585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.89 
 
 
544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  28.22 
 
 
568 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.01 
 
 
546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 
563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.31 
 
 
520 aa  163  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  26.42 
 
 
580 aa  163  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  26.27 
 
 
544 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.14 
 
 
548 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  27.46 
 
 
552 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  27.26 
 
 
565 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.42 
 
 
565 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.57 
 
 
583 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.54 
 
 
556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  25.79 
 
 
541 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  26.86 
 
 
583 aa  156  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.53 
 
 
539 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.08 
 
 
545 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  29.4 
 
 
531 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  27.15 
 
 
583 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  27.83 
 
 
540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 
548 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.46 
 
 
601 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  24.9 
 
 
550 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  26.97 
 
 
546 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.5 
 
 
575 aa  153  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.12 
 
 
583 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  28.39 
 
 
544 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.32 
 
 
575 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  26.88 
 
 
549 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>