67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2608 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  96.93 
 
 
358 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
358 aa  716    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  97.21 
 
 
358 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.26 
 
 
358 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.51 
 
 
354 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.51 
 
 
354 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  47.73 
 
 
347 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.3 
 
 
348 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.7 
 
 
348 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.7 
 
 
348 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  47.69 
 
 
354 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  45.97 
 
 
344 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  47.08 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  43.02 
 
 
346 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  45.29 
 
 
360 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  44.71 
 
 
354 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  44.15 
 
 
352 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  44.02 
 
 
368 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  39.08 
 
 
352 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  40.06 
 
 
353 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.41 
 
 
344 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  32.34 
 
 
355 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  33.03 
 
 
319 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  39.13 
 
 
302 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.24 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2061  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.3 
 
 
355 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0563567  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3502  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.31 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0829202  decreased coverage  0.000183537 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4022  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.08 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4344  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.08 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4562  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.31 
 
 
355 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451488  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.25 
 
 
332 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0134  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147618  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3398  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  25.36 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.860812  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7236  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  29.5 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.82896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  20.24 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.79 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.79 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1912  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  27.89 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  20.71 
 
 
327 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  22.05 
 
 
328 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  21.67 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  21.67 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1354  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  21.38 
 
 
360 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2160  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  30.23 
 
 
355 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.486423  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.42 
 
 
330 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  20.18 
 
 
328 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2096  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  29.46 
 
 
355 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522896  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  19.94 
 
 
328 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.39 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19500  hypothetical protein  25.15 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.26 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  19.76 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02360  putative binding protein component of ABC transporter  21.56 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000681113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  25.15 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0553  sulfate ester transport system substrate-binding protein  22.07 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.472296  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.3 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0267  sulfate ester transport system substrate-binding protein  21.99 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3482  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.45 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7503  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, aliphatic sulphonates  26.39 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0211  sulfate ester transport system substrate-binding protein  31.46 
 
 
337 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  21.67 
 
 
328 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7198  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  20.28 
 
 
357 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08170  sulfate ester transport system substrate-binding protein  29.71 
 
 
350 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2952  NMT1/THI5 like domain protein  22.47 
 
 
318 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2623  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  21.52 
 
 
364 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08130  ABC transporter, sulfate ester binding protein  28.68 
 
 
313 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>