More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2600 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  100 
 
 
773 aa  1575    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  93.66 
 
 
773 aa  1434    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  94.7 
 
 
771 aa  1449    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  40.84 
 
 
747 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 
794 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 
763 aa  324  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
765 aa  270  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 
775 aa  266  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 
755 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 
722 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 
728 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 
757 aa  258  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 
761 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
783 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.34 
 
 
739 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 
758 aa  252  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
731 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 
743 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 
743 aa  250  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 
737 aa  250  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 
776 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 
771 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 
704 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 
732 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 
746 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 
758 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
761 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 
790 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
761 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 
758 aa  243  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 
758 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 
756 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 
764 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 
750 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
792 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
779 aa  237  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 
736 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 
741 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
720 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 
769 aa  232  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 
774 aa  232  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
762 aa  232  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
725 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 
777 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
729 aa  230  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 
742 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 
763 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 
766 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
730 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.42 
 
 
715 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
790 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 
749 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
759 aa  224  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 
710 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
730 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  28.32 
 
 
738 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 
775 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 
808 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
726 aa  221  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
790 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
723 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 
748 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
743 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 
759 aa  217  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 
784 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 
779 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 
804 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 
728 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 
734 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 
726 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 
771 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
754 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 
780 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
764 aa  212  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
803 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 
778 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
758 aa  211  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
758 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
822 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 
780 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
726 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.69 
 
 
759 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 
745 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  29.67 
 
 
733 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.68 
 
 
790 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
755 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
809 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 
695 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 
778 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 
730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
733 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
796 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 
783 aa  201  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 
744 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 
755 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
817 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 
733 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 
777 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
767 aa  197  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>