30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2590 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  100 
 
 
457 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  30.84 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  31.23 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  27.47 
 
 
627 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.6 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  30.31 
 
 
564 aa  63.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  32.71 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  32.85 
 
 
517 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  26.64 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  27.02 
 
 
498 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  35.21 
 
 
578 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  28.57 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  31.27 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  28.31 
 
 
503 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  27.74 
 
 
441 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  28.07 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  30.41 
 
 
470 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  27.87 
 
 
496 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  27.2 
 
 
500 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  26.39 
 
 
502 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  27.87 
 
 
496 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  27.87 
 
 
496 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  28.22 
 
 
496 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  30.25 
 
 
482 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  32.19 
 
 
434 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  26.32 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1558  cryptic curlin major subunit  37.5 
 
 
149 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  26.55 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  32.41 
 
 
183 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  37.61 
 
 
180 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>