More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2385 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  93.6 
 
 		 375 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 375 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  92.8 
 
 		 375 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  92.8 
 
 		 375 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  80.11 
 
 		 375 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  59.27 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  58.75 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  57.84 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  57.55 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  50.13 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  51.15 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  50.38 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  52.27 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51.77 
 
 		 381 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.01 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  53.51 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  51.15 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  51.91 
 
 		 383 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  51.65 
 
 		 383 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  50.89 
 
 		 391 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.66 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  50.64 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  50.64 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.05 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.41 
 
 		 379 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.41 
 
 		 379 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.41 
 
 		 379 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.15 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.15 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  50.26 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  50 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  50.9 
 
 		 379 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  49.48 
 
 		 380 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  51.35 
 
 		 379 aa  328  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  51.41 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  50.26 
 
 		 383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  51.16 
 
 		 380 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  49.61 
 
 		 381 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  48.42 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  50.54 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  50.54 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  50.54 
 
 		 380 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  49.35 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  49.35 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  50.54 
 
 		 379 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  49.35 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  49.35 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  49.35 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  49.35 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  49.35 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  48.72 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  49.61 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  48.58 
 
 		 414 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  48.2 
 
 		 403 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.63 
 
 		 383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  48.31 
 
 		 394 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  50.13 
 
 		 384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  48.61 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48.18 
 
 		 377 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  48.58 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  48.13 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  48.13 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  47.57 
 
 		 419 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  47.55 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  47.86 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  47.86 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  47.86 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  47.86 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  50.68 
 
 		 383 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  47.61 
 
 		 419 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  47.06 
 
 		 403 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  47.06 
 
 		 403 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  48.08 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  47.06 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  47.84 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  48.84 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  48.84 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  46.5 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  48.58 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  48.58 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  46.39 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  48.58 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.99 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.03 
 
 		 384 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  48.06 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  47.4 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  49.45 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  47.79 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.25 
 
 		 384 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.51 
 
 		 384 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.25 
 
 		 384 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.25 
 
 		 384 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  44.68 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  44.68 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  44.85 
 
 		 418 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  45.91 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  44.41 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  46.74 
 
 		 382 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  46.74 
 
 		 382 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  47.67 
 
 		 386 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>