More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2342 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2342  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3757  LysR family transcriptional regulator  93.79 
 
 		 306 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4606  LysR family transcriptional regulator  93.79 
 
 		 306 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3766  LysR family transcriptional regulator  93.14 
 
 		 306 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.290887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5488  LysR family transcriptional regulator  91.5 
 
 		 306 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3634  LysR family transcriptional regulator  91.18 
 
 		 306 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4973  LysR family transcriptional regulator  84.97 
 
 		 306 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 349 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 362 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  38.64 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0723  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 328 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3919  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 327 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0706  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2428  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.886071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0104  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3206  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000350263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2557  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0343  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0826  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.325124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535454  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000114793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1403  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000529291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4615  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0591659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5689  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3753  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2140  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0604  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0796  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1192  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000735562  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1227  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4124  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.774115  decreased coverage  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3968  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 312 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3219  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00312841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3327  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114009  normal  0.9019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3439  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0327434  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  34.36 
 
 		 298 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0695  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000273507  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0839  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0269  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.25 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3156  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000483738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4929  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00665073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1015  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.688296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>