41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2339 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  100 
 
 
154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  92.16 
 
 
159 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  90.85 
 
 
159 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  90.2 
 
 
159 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  89.86 
 
 
149 aa  254  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  88.51 
 
 
149 aa  246  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  75.66 
 
 
152 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  60.74 
 
 
166 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  59.82 
 
 
150 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  38.81 
 
 
563 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  40 
 
 
580 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  40.87 
 
 
580 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  42.86 
 
 
580 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  49.44 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  36.94 
 
 
563 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  34.75 
 
 
576 aa  80.9  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  32.28 
 
 
652 aa  80.1  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  39.58 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  41.05 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  37.11 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  41.98 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  36.46 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  41.56 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  36.26 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  38.54 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  38.54 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  38.54 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  38.67 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  33.33 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  30.93 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  30.93 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  35.44 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  27.08 
 
 
128 aa  48.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  26.58 
 
 
118 aa  43.9  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  27.41 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  31.96 
 
 
130 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  28.15 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  28.15 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>