More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2320 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  100 
 
 
381 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  65.6 
 
 
386 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0350  OmpC family outer membrane porin  41.14 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000145681  hitchhiker  0.00000929748 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  38.31 
 
 
365 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  37.47 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  35.9 
 
 
363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  33.81 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  34.1 
 
 
376 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  34.1 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  33.85 
 
 
376 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  34.21 
 
 
357 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  33.24 
 
 
347 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  33.5 
 
 
378 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  33.68 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  33.68 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  33.08 
 
 
377 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  33.08 
 
 
377 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  33.08 
 
 
377 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  33.68 
 
 
357 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  33.08 
 
 
377 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.17 
 
 
389 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  32.83 
 
 
377 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  32.83 
 
 
377 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.83 
 
 
379 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  34.51 
 
 
413 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  32.83 
 
 
377 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5535  porin Gram-negative type  32.9 
 
 
391 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.438233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  32.79 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  32.79 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.66 
 
 
385 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.66 
 
 
385 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  35.34 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  35.34 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  34.06 
 
 
387 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  29.52 
 
 
398 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  35.34 
 
 
386 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  31.68 
 
 
382 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  34.2 
 
 
373 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  34.5 
 
 
386 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  34.5 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  32.9 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  32.99 
 
 
364 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  34.24 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  32.58 
 
 
373 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  32.58 
 
 
373 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  33.67 
 
 
386 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  32.58 
 
 
373 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  32.37 
 
 
388 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.36 
 
 
383 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32.37 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  35.49 
 
 
389 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  32.55 
 
 
356 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.36 
 
 
383 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  34.12 
 
 
354 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  34.12 
 
 
354 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.36 
 
 
383 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  33.58 
 
 
383 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  31.8 
 
 
383 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  33.82 
 
 
436 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  32.9 
 
 
384 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  32.9 
 
 
384 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  31.13 
 
 
369 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  32.61 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  34.92 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  32.38 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0189  porin Gram-negative type  35.81 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615373  hitchhiker  0.00390966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  33.33 
 
 
397 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  32.85 
 
 
397 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  34.79 
 
 
389 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  34.66 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  33.33 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  33.33 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  33.33 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  33.33 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  33.33 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  32.37 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  33.33 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  32.37 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0973  OmpC family outer membrane porin  31.78 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000310087  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  32.37 
 
 
397 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  34.16 
 
 
393 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  34.39 
 
 
382 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  32.13 
 
 
397 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  34.39 
 
 
382 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  34.39 
 
 
382 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3027  outer membrane protein (porin)  31.28 
 
 
352 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0984203  normal  0.75673 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  33.09 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  34.05 
 
 
383 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  34.62 
 
 
375 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  33.98 
 
 
375 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  33 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  32.54 
 
 
387 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  33.16 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  33.16 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  31.92 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  32.76 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  30.45 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  34.94 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  31.51 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>