More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2223 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2223  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5623  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.919335  normal  0.153906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05493  transcription regulator protein  38.14 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.564857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2438  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6102  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2143  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101514 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5557  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5786  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  33 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  36.61 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2405  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2423  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.896405 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5603  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4625  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5256  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0091  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 353 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 327 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3099  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2342  transcriptional regulator, LysR family  36.97 
 
 		 344 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5409  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 347 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  36.55 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3618  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2573  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.888641  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  35.97 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1996  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3807  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.832757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6638  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>