More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2202 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
488 aa  990    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  90.14 
 
 
488 aa  890    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  90.14 
 
 
488 aa  890    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  90.14 
 
 
488 aa  890    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.65 
 
 
489 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  54.62 
 
 
492 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  57.53 
 
 
488 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  54.12 
 
 
492 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  52.27 
 
 
495 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  53.99 
 
 
502 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  53.99 
 
 
511 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  53.99 
 
 
502 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  53.99 
 
 
502 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  53.99 
 
 
502 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  54.02 
 
 
498 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  53.59 
 
 
502 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  53.8 
 
 
502 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.74 
 
 
491 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
507 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.62 
 
 
507 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  43.87 
 
 
487 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.94 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.37 
 
 
497 aa  356  5.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.77 
 
 
503 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  42.98 
 
 
502 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
502 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
502 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.75 
 
 
501 aa  348  9e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  42.8 
 
 
515 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  42.4 
 
 
503 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 
503 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.58 
 
 
495 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.22 
 
 
515 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  40.92 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
513 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  40.92 
 
 
502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  43.84 
 
 
492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.59 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  39.17 
 
 
511 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
507 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  41.38 
 
 
501 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
506 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
509 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
506 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
569 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  39.68 
 
 
507 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  40.62 
 
 
488 aa  333  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
501 aa  333  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 
524 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 
492 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
507 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  41.26 
 
 
509 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
506 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
506 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
501 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.49 
 
 
504 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.08 
 
 
501 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
515 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
506 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  42.68 
 
 
490 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
506 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
501 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.91 
 
 
507 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  37.99 
 
 
520 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  39.17 
 
 
507 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
507 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
507 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  43.71 
 
 
492 aa  326  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  38.15 
 
 
521 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
486 aa  323  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
501 aa  323  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  38.54 
 
 
523 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
564 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
564 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  39.96 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
495 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.63 
 
 
496 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  39.02 
 
 
499 aa  312  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
562 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
564 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  39.96 
 
 
564 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  39.2 
 
 
502 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.17 
 
 
471 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.39 
 
 
472 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 
494 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  36.97 
 
 
490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  38.88 
 
 
478 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
493 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
490 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.04 
 
 
473 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  40.18 
 
 
476 aa  276  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  37.42 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.26 
 
 
514 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  36.12 
 
 
496 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>