More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2165 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
313 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3026  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 
313 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2911  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 
333 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.960464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0345  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 
313 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476042  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1527  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 
313 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0378  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 
313 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1717  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 
313 aa  255  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0449608  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1258  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 
316 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
319 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  40 
 
 
319 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
314 aa  188  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
308 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
307 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 
323 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
300 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0503  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
309 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000831033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
311 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
333 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
318 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
305 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
342 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.78 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
307 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 
310 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
301 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
326 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  34 
 
 
310 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
302 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 
309 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 
307 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
322 aa  168  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.81 
 
 
300 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
307 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.11 
 
 
300 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 
304 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
301 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 
302 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1762  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 
321 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  36.67 
 
 
304 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0997  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 
302 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940452  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
315 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0100  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
318 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  0.148828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3262  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1036  transcriptional regulator of LysR family protein  34.48 
 
 
313 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 
314 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5043  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
303 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
432 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
297 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 
326 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
311 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5845  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
301 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151621  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
312 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5015  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
301 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5082  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3222  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
301 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
307 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
307 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
307 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
307 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
308 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
299 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
307 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
301 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
297 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
307 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
308 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
300 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
334 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
297 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5282  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
310 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
297 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
297 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
298 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
297 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>