More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2117 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  95.96 
 
 
396 aa  763    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.87 
 
 
423 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.82 
 
 
394 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.36 
 
 
396 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.36 
 
 
423 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  95.47 
 
 
410 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.87 
 
 
405 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 
396 aa  812    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.87 
 
 
423 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  87.37 
 
 
405 aa  703    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.36 
 
 
423 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  89.9 
 
 
396 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  86.36 
 
 
396 aa  697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  95.71 
 
 
396 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  89.39 
 
 
396 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  94.96 
 
 
410 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  95.96 
 
 
396 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  95.96 
 
 
396 aa  763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  76.02 
 
 
401 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.79 
 
 
402 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.67 
 
 
393 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.84 
 
 
402 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.58 
 
 
402 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.82 
 
 
394 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.93 
 
 
389 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.04 
 
 
395 aa  522  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.86 
 
 
411 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  62.31 
 
 
393 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.93 
 
 
397 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.59 
 
 
392 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.93 
 
 
404 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.18 
 
 
403 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.93 
 
 
404 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.51 
 
 
404 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.29 
 
 
406 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.62 
 
 
383 aa  471  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.38 
 
 
403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.87 
 
 
407 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.29 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.28 
 
 
403 aa  464  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.21 
 
 
397 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.33 
 
 
397 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.9 
 
 
406 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.06 
 
 
413 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.3 
 
 
404 aa  455  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.56 
 
 
452 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.89 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.3 
 
 
404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.14 
 
 
403 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.69 
 
 
399 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.11 
 
 
396 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  58.16 
 
 
414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.73 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.63 
 
 
403 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.95 
 
 
402 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.99 
 
 
403 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.87 
 
 
403 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.61 
 
 
403 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.67 
 
 
434 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.61 
 
 
403 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.73 
 
 
407 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.38 
 
 
391 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.63 
 
 
396 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  54 
 
 
424 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.65 
 
 
419 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.36 
 
 
422 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.54 
 
 
396 aa  411  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.79 
 
 
402 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.37 
 
 
417 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  52.32 
 
 
396 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.8 
 
 
402 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.12 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.25 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.25 
 
 
411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.04 
 
 
412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.15 
 
 
410 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.87 
 
 
406 aa  401  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.78 
 
 
412 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.78 
 
 
412 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.42 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  50.39 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.08 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.77 
 
 
403 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  49.22 
 
 
392 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.81 
 
 
408 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  48.7 
 
 
402 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.52 
 
 
408 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.68 
 
 
397 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.2 
 
 
413 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3120  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.62 
 
 
428 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.97 
 
 
401 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.03 
 
 
406 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.35 
 
 
394 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0536  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.22 
 
 
400 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.71 
 
 
397 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.86 
 
 
395 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  46.27 
 
 
388 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.11 
 
 
408 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.68 
 
 
422 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.84 
 
 
396 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>