More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2103 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
385 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  91.43 
 
 
385 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  91.43 
 
 
385 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  85.87 
 
 
386 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  80.61 
 
 
430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  80.61 
 
 
430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  80.33 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  80.33 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  80.33 
 
 
411 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  80.61 
 
 
384 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  80.33 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  78.85 
 
 
385 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  78.85 
 
 
385 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  78.57 
 
 
385 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  72.96 
 
 
394 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  75.41 
 
 
523 aa  544  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  64.96 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  66.84 
 
 
386 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  66.84 
 
 
386 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  66.84 
 
 
386 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  66.84 
 
 
386 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  66.84 
 
 
386 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  67.95 
 
 
386 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  65.04 
 
 
386 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  68.02 
 
 
393 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  68.27 
 
 
393 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  65.48 
 
 
388 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  63.43 
 
 
390 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  61.62 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  63.61 
 
 
404 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  61.72 
 
 
386 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  61.46 
 
 
386 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  62.91 
 
 
386 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  62.26 
 
 
386 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  62.26 
 
 
386 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  58.33 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  57 
 
 
390 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  57.18 
 
 
430 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  56.67 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  56.92 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  56.92 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  56.67 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  56.67 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  56.49 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  56.67 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  57.45 
 
 
390 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  57.18 
 
 
390 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  56.64 
 
 
390 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  56.64 
 
 
390 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  55.7 
 
 
376 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  52.07 
 
 
376 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  52.07 
 
 
376 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  51.81 
 
 
376 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  50.39 
 
 
389 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  50.13 
 
 
389 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.6 
 
 
385 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  48.35 
 
 
385 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  49.11 
 
 
383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  49.13 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  48.86 
 
 
383 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  48.35 
 
 
383 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  48.35 
 
 
383 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  46.94 
 
 
436 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  46.94 
 
 
386 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  46.94 
 
 
386 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  46.94 
 
 
386 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  47.19 
 
 
436 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  46.94 
 
 
386 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  46.94 
 
 
386 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  46.68 
 
 
386 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  45.07 
 
 
399 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  45.07 
 
 
399 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  45.07 
 
 
399 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  45.07 
 
 
399 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  45.07 
 
 
399 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  45.22 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  45.48 
 
 
391 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.96 
 
 
421 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.96 
 
 
421 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  44.59 
 
 
378 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  47.7 
 
 
402 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 
389 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  44.7 
 
 
397 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.97 
 
 
389 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.96 
 
 
397 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  44.96 
 
 
397 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.95 
 
 
389 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  44.3 
 
 
445 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.96 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  45.22 
 
 
395 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  44.7 
 
 
393 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  45.22 
 
 
395 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  45.22 
 
 
394 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  45.22 
 
 
395 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  45.19 
 
 
403 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  43.55 
 
 
400 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  44.04 
 
 
394 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.75 
 
 
395 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  43.53 
 
 
381 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  45.18 
 
 
386 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>