More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2043 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  77.45 
 
 
582 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  100 
 
 
523 aa  996    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  76.37 
 
 
587 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  92.81 
 
 
518 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  92.38 
 
 
519 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  77.75 
 
 
553 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  67.9 
 
 
521 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  68.89 
 
 
532 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  56.31 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.06 
 
 
504 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  49.79 
 
 
510 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0868  major facilitator family protein  72.4 
 
 
334 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1155  drug resistance transporter family protein  72.4 
 
 
334 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0301  major facilitator superfamily permease  72.4 
 
 
334 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0446618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 
511 aa  329  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.86 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.17 
 
 
522 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  35.17 
 
 
512 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  35.93 
 
 
512 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  36.5 
 
 
506 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  35.53 
 
 
519 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 
516 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 
478 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  35.24 
 
 
512 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.12 
 
 
522 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  35.39 
 
 
512 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  35.93 
 
 
512 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 
522 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.15 
 
 
525 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.93 
 
 
543 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  35.93 
 
 
512 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  35.93 
 
 
512 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  35.73 
 
 
528 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 
527 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.1 
 
 
519 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
515 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 
487 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0867  RemN protein  85.48 
 
 
558 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.68 
 
 
509 aa  204  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  35.19 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.45 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1154  hypothetical protein  85.48 
 
 
243 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 
532 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.15 
 
 
502 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.95 
 
 
468 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 
452 aa  200  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.82 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.4 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  30.85 
 
 
529 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.46 
 
 
458 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.58 
 
 
504 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  31 
 
 
500 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.06 
 
 
531 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.24 
 
 
476 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  34.67 
 
 
513 aa  194  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.99 
 
 
508 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 
763 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 
520 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.58 
 
 
505 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 
498 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  34.63 
 
 
463 aa  190  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.53 
 
 
492 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.7 
 
 
478 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
488 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 
485 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  37.68 
 
 
444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  35.66 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  36.61 
 
 
469 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.54 
 
 
521 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  36.98 
 
 
480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
483 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.14 
 
 
539 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.64 
 
 
502 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 
513 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.49 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.88 
 
 
489 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 
525 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.95 
 
 
522 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 
534 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 
486 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
463 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 
508 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 
488 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.33 
 
 
499 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
490 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
507 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 
472 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 
478 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.13 
 
 
553 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 
478 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>