56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1946 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  91.73 
 
 		 278 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  91.73 
 
 		 278 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  91.73 
 
 		 278 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  88.49 
 
 		 278 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  88.13 
 
 		 278 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  81.65 
 
 		 280 aa  454  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  65.83 
 
 		 278 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  51.21 
 
 		 266 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  48.79 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  47.98 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  48.39 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  46.97 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  46.49 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  46.86 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  43.45 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  47.72 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  43.45 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  37.15 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  37.15 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  40.56 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  35.97 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  24.04 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  35.67 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  23.34 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  32.67 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  41.57 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 117 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 117 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2129  hypothetical protein  29.02 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  28.21 
 
 		 133 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  29.52 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  34.65 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 98 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1719  hypothetical protein  28.12 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  38.27 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  35.09 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  35.16 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  30.08 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  31.31 
 
 		 427 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  34.41 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  28.05 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  26.28 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2219  hypothetical protein  29.1 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  36.14 
 
 		 104 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 647 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  32.08 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  36.08 
 
 		 636 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  25.88 
 
 		 209 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  32.99 
 
 		 141 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 647 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2083  hypothetical protein  27.81 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00771953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0161  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.87 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.822245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  30.93 
 
 		 358 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>