More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1849 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  93.16 
 
 
307 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  93.16 
 
 
307 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  93.16 
 
 
307 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  74.75 
 
 
304 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  74.75 
 
 
304 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
290 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
297 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
291 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
302 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
302 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
302 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
302 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
303 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
295 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
296 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
320 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.91 
 
 
308 aa  138  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
294 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
298 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  33.01 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  35.28 
 
 
298 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
296 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
300 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
294 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  31.53 
 
 
302 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
296 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  32.09 
 
 
310 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
301 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  31.05 
 
 
301 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  30.84 
 
 
300 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 
294 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  31.52 
 
 
302 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  31.31 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  29.87 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  28.98 
 
 
303 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 
310 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  33.96 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  32.82 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
290 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  42.06 
 
 
289 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  43.07 
 
 
302 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
290 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 
356 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  31.85 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  31.85 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  31.85 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  28.34 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  31.07 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  42.24 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
296 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  27.5 
 
 
306 aa  92.4  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  49.02 
 
 
118 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 
275 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  29.24 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.12 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
861 aa  89  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 
291 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  42.74 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  41.44 
 
 
321 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.67 
 
 
639 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  40.52 
 
 
293 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  40.52 
 
 
302 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
284 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 
281 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
289 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.62 
 
 
461 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  41.18 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.04 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>