241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1715 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  100 
 
 
391 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  95.91 
 
 
391 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  95.64 
 
 
391 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  94.63 
 
 
391 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  95.64 
 
 
391 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  43.67 
 
 
391 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  43.67 
 
 
391 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  43.41 
 
 
391 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  39.58 
 
 
420 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  39.58 
 
 
420 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  46.85 
 
 
408 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  46.85 
 
 
438 aa  245  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  35.88 
 
 
417 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  36.27 
 
 
402 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  36.27 
 
 
402 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  35.88 
 
 
417 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  35.88 
 
 
417 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  35.88 
 
 
417 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  35.88 
 
 
417 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  35.88 
 
 
417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  35.62 
 
 
417 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  40.74 
 
 
416 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.22 
 
 
388 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  32.73 
 
 
395 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  33.21 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.86 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  31.37 
 
 
399 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.85 
 
 
341 aa  91.3  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.82 
 
 
336 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 
347 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.53 
 
 
531 aa  89.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.22 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  30.31 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  28.22 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.47 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  29.22 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  28.28 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.46 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.17 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.9 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.69 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26.64 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.67 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.56 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.48 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  26.5 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  22.22 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.39 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.01 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.01 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.21 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.01 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.39 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  24.29 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.39 
 
 
334 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  23.24 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.39 
 
 
330 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.04 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  29.96 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.05 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  28.08 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  28.23 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.88 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 
457 aa  69.7  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  30.33 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  30.22 
 
 
567 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.53 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.86 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  24.22 
 
 
517 aa  66.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  28.28 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 
350 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  25.36 
 
 
313 aa  64.3  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  22.13 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 
332 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  28.69 
 
 
386 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  23.81 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  26.21 
 
 
341 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  23.53 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  23.35 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  25.54 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  24.14 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  26.87 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.06 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 
542 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  28.11 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>