More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1692 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  100 
 
 
414 aa  841    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  60.5 
 
 
408 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  59.08 
 
 
418 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  58.02 
 
 
420 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  57.87 
 
 
424 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  58 
 
 
420 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  58 
 
 
420 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  58.84 
 
 
424 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  57.78 
 
 
420 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  59.6 
 
 
417 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  56.42 
 
 
424 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  56.54 
 
 
422 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  59.22 
 
 
420 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  51.69 
 
 
407 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  49.87 
 
 
370 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  47.54 
 
 
445 aa  356  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  49.88 
 
 
406 aa  355  6.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  47.39 
 
 
414 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  46.75 
 
 
406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  48 
 
 
400 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  49.75 
 
 
410 aa  348  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  47.49 
 
 
405 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  47.49 
 
 
405 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  47.24 
 
 
405 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  45.17 
 
 
417 aa  298  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  40.3 
 
 
419 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  43.17 
 
 
402 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  40.14 
 
 
411 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  43.96 
 
 
453 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  41.23 
 
 
438 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  40.79 
 
 
412 aa  264  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  38.52 
 
 
411 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  38.85 
 
 
408 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  39.05 
 
 
426 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  38.77 
 
 
399 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  39.1 
 
 
411 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  40.83 
 
 
407 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  38.61 
 
 
440 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  38.69 
 
 
407 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  39.2 
 
 
407 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  38.2 
 
 
423 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  37.44 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  37.84 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  38.24 
 
 
424 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  37.86 
 
 
454 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  38.14 
 
 
415 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  35.61 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  36.12 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  38.25 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  39.01 
 
 
401 aa  229  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  37.63 
 
 
401 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  36.1 
 
 
426 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  37.2 
 
 
427 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  39.58 
 
 
613 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  36.89 
 
 
401 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  36.89 
 
 
401 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  36.99 
 
 
401 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  38.48 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  34.88 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  33.17 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  33.91 
 
 
382 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  35.96 
 
 
431 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  37.34 
 
 
422 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  37.03 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  37.37 
 
 
418 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  36.83 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  36.41 
 
 
452 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  33.67 
 
 
435 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  35.01 
 
 
395 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  35.82 
 
 
468 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  37.11 
 
 
437 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  37.7 
 
 
440 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  35.56 
 
 
395 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  35.91 
 
 
430 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  36.3 
 
 
436 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  33 
 
 
432 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  34.96 
 
 
444 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  33.85 
 
 
395 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  34.35 
 
 
438 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  35.62 
 
 
419 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  35.56 
 
 
409 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  35.96 
 
 
394 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  35.32 
 
 
416 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  34.09 
 
 
391 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  35.15 
 
 
431 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  33.75 
 
 
411 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  32.19 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  34.86 
 
 
396 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  33.16 
 
 
422 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  32.74 
 
 
438 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  32.61 
 
 
397 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  35.57 
 
 
397 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  34.4 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  34.4 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2613  beta-lactamase  33.42 
 
 
398 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  33.5 
 
 
396 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2901  beta-lactamase  32.91 
 
 
760 aa  170  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  29.95 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  35.77 
 
 
389 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  32.28 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>