More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1659 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  76.42 
 
 
844 aa  1132    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  71.27 
 
 
743 aa  1053    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  88.89 
 
 
888 aa  1369    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  70.91 
 
 
743 aa  1050    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  76.4 
 
 
839 aa  1125    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  94.61 
 
 
857 aa  1521    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  66.72 
 
 
846 aa  901    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  94.86 
 
 
858 aa  1507    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  70.27 
 
 
698 aa  991    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  69.11 
 
 
850 aa  1040    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  64.09 
 
 
810 aa  905    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  76.17 
 
 
928 aa  1138    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  63.34 
 
 
846 aa  915    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  76.4 
 
 
839 aa  1126    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  69.2 
 
 
742 aa  1043    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
862 aa  1753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  90.71 
 
 
857 aa  1451    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  79.67 
 
 
787 aa  1100    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  76.42 
 
 
844 aa  1132    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  58.26 
 
 
678 aa  771    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  76.56 
 
 
844 aa  1123    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  56.7 
 
 
675 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  63.71 
 
 
801 aa  906    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  74.28 
 
 
838 aa  1130    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.92 
 
 
846 aa  913    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  62.57 
 
 
841 aa  905    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  57.33 
 
 
686 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  70.67 
 
 
826 aa  1029    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  76.42 
 
 
844 aa  1132    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  70.91 
 
 
743 aa  1050    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  94.61 
 
 
857 aa  1521    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  70.89 
 
 
787 aa  1043    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  71.41 
 
 
732 aa  1012    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  73.94 
 
 
834 aa  1105    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  66.06 
 
 
821 aa  1111    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  92.06 
 
 
870 aa  1450    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  71.26 
 
 
728 aa  1008    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  49.7 
 
 
783 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.62 
 
 
743 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.98 
 
 
850 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.57 
 
 
750 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  39.38 
 
 
730 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  38.58 
 
 
762 aa  435  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.75 
 
 
774 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.46 
 
 
752 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 
755 aa  426  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  38.46 
 
 
760 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.65 
 
 
854 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  36.84 
 
 
740 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.22 
 
 
815 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.6 
 
 
786 aa  414  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
768 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.98 
 
 
794 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.53 
 
 
762 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.14 
 
 
786 aa  399  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.31 
 
 
759 aa  399  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.09 
 
 
772 aa  393  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.09 
 
 
907 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  34.06 
 
 
765 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.48 
 
 
767 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.12 
 
 
785 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  34.12 
 
 
776 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.53 
 
 
773 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 
661 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  31.04 
 
 
771 aa  306  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  31.9 
 
 
766 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  30.39 
 
 
823 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.27 
 
 
646 aa  300  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  30.52 
 
 
823 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.86 
 
 
679 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.97 
 
 
648 aa  294  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.54 
 
 
712 aa  293  7e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  32.1 
 
 
790 aa  293  7e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.81 
 
 
748 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  29.53 
 
 
817 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  29.53 
 
 
817 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.13 
 
 
707 aa  291  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  30.47 
 
 
804 aa  291  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.83 
 
 
795 aa  290  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  31.41 
 
 
810 aa  290  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.01 
 
 
625 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
709 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.6 
 
 
713 aa  287  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  33.6 
 
 
713 aa  287  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  33.6 
 
 
713 aa  287  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  29.06 
 
 
819 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  33.44 
 
 
709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  32.17 
 
 
790 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.9 
 
 
761 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  29.83 
 
 
832 aa  285  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
713 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 
793 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
713 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 
713 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  31.52 
 
 
807 aa  284  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.01 
 
 
649 aa  284  6.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  33.49 
 
 
714 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  32.01 
 
 
687 aa  281  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  32.63 
 
 
850 aa  280  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>