More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1552 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 563 aa  1128    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  29.49 
 
 		 553 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  29.49 
 
 		 553 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  29.32 
 
 		 553 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  30.23 
 
 		 555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  32.14 
 
 		 552 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  32.14 
 
 		 552 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  32.29 
 
 		 552 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  32.14 
 
 		 552 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  31.99 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  32.07 
 
 		 553 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  29.53 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  29.65 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  30.85 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  31.47 
 
 		 553 aa  190  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  29.26 
 
 		 565 aa  187  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  31.22 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  31.01 
 
 		 552 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  31.01 
 
 		 551 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  30.8 
 
 		 551 aa  183  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  31.01 
 
 		 551 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  31.01 
 
 		 551 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  30.8 
 
 		 551 aa  183  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.55 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  31.01 
 
 		 552 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.21 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.84 
 
 		 596 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.8 
 
 		 596 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.84 
 
 		 596 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.67 
 
 		 596 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.92 
 
 		 579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.04 
 
 		 579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.67 
 
 		 596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.58 
 
 		 579 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  24.24 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  24.24 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 569 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.3 
 
 		 579 aa  166  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 566 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  25.78 
 
 		 566 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 566 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 566 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  25.61 
 
 		 566 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  27.66 
 
 		 568 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  26.71 
 
 		 569 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  25.68 
 
 		 566 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.55 
 
 		 566 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 566 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  25.55 
 
 		 566 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  25.51 
 
 		 566 aa  153  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 566 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  25.51 
 
 		 566 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 566 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 578 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  24.91 
 
 		 585 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 571 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 578 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  26.34 
 
 		 637 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  24.01 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  28.78 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  24.01 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  27.86 
 
 		 578 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 578 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 575 aa  131  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  24.76 
 
 		 536 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  28.2 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 578 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  25.54 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.28 
 
 		 567 aa  117  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.76 
 
 		 569 aa  117  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  23.1 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  23.46 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  22.46 
 
 		 555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  20.75 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  28.42 
 
 		 345 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  21.08 
 
 		 589 aa  98.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.45 
 
 		 554 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  22.91 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 538 aa  80.5  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 540 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  29.15 
 
 		 532 aa  80.1  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 515 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 561 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.26 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.32 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  24.04 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>