More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1546 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  87.19 
 
 		 398 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  87.18 
 
 		 471 aa  700    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  86.08 
 
 		 418 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  82.54 
 
 		 418 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  86.6 
 
 		 403 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 403 aa  812    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  86.6 
 
 		 403 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  80.87 
 
 		 419 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  83.87 
 
 		 407 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  83.87 
 
 		 407 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  83.87 
 
 		 419 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  83.87 
 
 		 407 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  83.87 
 
 		 407 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  83.87 
 
 		 407 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  83.87 
 
 		 407 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.98 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  48.98 
 
 		 409 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  48.98 
 
 		 409 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  47.3 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  47.04 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  48.2 
 
 		 384 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  47.4 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  47.66 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  48.2 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  47 
 
 		 386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  45.36 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  45.36 
 
 		 381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  44.67 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  45.06 
 
 		 383 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  44.81 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  44.87 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  45.08 
 
 		 375 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45.79 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  45.08 
 
 		 375 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  45.08 
 
 		 375 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  44.44 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  44.44 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  44.44 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  44.47 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  44.44 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  44.56 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  44.19 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  45.41 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  45.03 
 
 		 379 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  44.39 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  47.8 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  46.98 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  46.23 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  45.69 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  43.77 
 
 		 384 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  44.56 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  43.77 
 
 		 384 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  45.69 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  43.77 
 
 		 384 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  43.77 
 
 		 384 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  45.69 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  43.77 
 
 		 384 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  43.77 
 
 		 384 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  43.77 
 
 		 384 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  45.69 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  45.09 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  45.43 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  45.43 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  44.65 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  45.36 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.03 
 
 		 385 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  45.1 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.78 
 
 		 385 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  43.5 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  44.41 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.28 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  44.28 
 
 		 391 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  41.71 
 
 		 383 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  42.78 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  44.67 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  42.51 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  43.39 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  45.99 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.28 
 
 		 380 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  42.78 
 
 		 384 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  42.78 
 
 		 384 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  42.78 
 
 		 384 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.89 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.89 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  42.51 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  42.16 
 
 		 389 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  43.25 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  42.54 
 
 		 380 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.64 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  43.98 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  43.72 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.75 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  41.83 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  41.83 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  43.72 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  43.39 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  41.06 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.11 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  40.39 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  43.19 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>