More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1400 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  100 
 
 		 421 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  72.66 
 
 		 430 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  73.39 
 
 		 430 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  73.64 
 
 		 430 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  73.39 
 
 		 430 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  71.22 
 
 		 447 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  68.09 
 
 		 419 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  63.77 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.08 
 
 		 432 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  66.08 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  63.66 
 
 		 468 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.32 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.33 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  64.16 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  64.25 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  64.25 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  64.25 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  64.25 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  64.25 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  63.66 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.22 
 
 		 432 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  64.25 
 
 		 432 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  64.25 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  64.25 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  65.22 
 
 		 432 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  64.45 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  64.45 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  64.45 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  51.29 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  51.17 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.44 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  51.75 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  51.44 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  48.32 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.68 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  48.99 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  48.26 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  48.84 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.52 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.25 
 
 		 444 aa  349  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.8 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  46.36 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  43.16 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  41.2 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.65 
 
 		 422 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.98 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.19 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  42.65 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  42.89 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.54 
 
 		 440 aa  312  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  42.93 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  42.82 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  40.99 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  42.27 
 
 		 450 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  42.93 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.18 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.35 
 
 		 439 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  40.47 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  40 
 
 		 447 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  41.81 
 
 		 439 aa  302  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.81 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  42.46 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.5 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.09 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  42.09 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  42.09 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.33 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  40.19 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  42.13 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.6 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.17 
 
 		 531 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  41.37 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.6 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  41.37 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.88 
 
 		 441 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.12 
 
 		 434 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.15 
 
 		 448 aa  293  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.88 
 
 		 434 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  42.36 
 
 		 477 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.72 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.96 
 
 		 477 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.21 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.07 
 
 		 537 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  42.79 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  41.61 
 
 		 476 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.48 
 
 		 531 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.7 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.61 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.54 
 
 		 680 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.65 
 
 		 530 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.76 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.27 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  39.4 
 
 		 438 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.43 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  42.43 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.43 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  42.43 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  40.41 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>