More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1359 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
240 aa  480  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  93.75 
 
 
240 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  96.25 
 
 
240 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  96.25 
 
 
240 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  63 
 
 
245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  63.83 
 
 
245 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  62.39 
 
 
245 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  43.29 
 
 
244 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  38.32 
 
 
244 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  36.45 
 
 
244 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  36.45 
 
 
244 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
269 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  42.27 
 
 
253 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 
250 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  36.12 
 
 
249 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  39.44 
 
 
235 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  39.83 
 
 
239 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  36.12 
 
 
249 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  36.12 
 
 
249 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  36.12 
 
 
249 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  41.97 
 
 
237 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  36.41 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  36.41 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  36.99 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  43.46 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  43.46 
 
 
234 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 
255 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  39.27 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  39.62 
 
 
223 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
256 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
257 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 
255 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
251 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  41.31 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.56 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  33.77 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  33.77 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.56 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  33.77 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.56 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.77 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.33 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.77 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.77 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.87 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.77 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.77 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.41 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  43.06 
 
 
233 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.19 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  34.58 
 
 
255 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  39.53 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  34.86 
 
 
255 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 
257 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  35.29 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  37.67 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  39.63 
 
 
258 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  37.79 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.79 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  37.56 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.56 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.56 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  37.79 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.56 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.81 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  37.56 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  41.07 
 
 
252 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
265 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  39.47 
 
 
250 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.07 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  36.99 
 
 
258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  40.85 
 
 
233 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  40.85 
 
 
233 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  40.85 
 
 
233 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  40.84 
 
 
252 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 
253 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 
253 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 
253 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 
252 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  37.55 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  35.32 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  35.32 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  35.32 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0743  GntR domain-containing protein  37.77 
 
 
286 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  37.02 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0881  GntR domain protein  35.63 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>