188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1295 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  100 
 
 		 178 aa  357  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  83.71 
 
 		 174 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  83.24 
 
 		 174 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  90.65 
 
 		 139 aa  237  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  94.24 
 
 		 139 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  94.24 
 
 		 139 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  94.24 
 
 		 139 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  70 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  66.41 
 
 		 137 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  64.34 
 
 		 137 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  65.77 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  65.77 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  67.11 
 
 		 167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  67.11 
 
 		 167 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  66.44 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  67.65 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  67.65 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  54.96 
 
 		 137 aa  151  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  54.96 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  53.44 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  57.94 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  49.61 
 
 		 137 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  49.61 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  47.24 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  51.94 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  51.94 
 
 		 140 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  51.94 
 
 		 140 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  51.94 
 
 		 140 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  51.94 
 
 		 140 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  51.94 
 
 		 140 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  51.94 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  51.94 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  51.94 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  54.96 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  54.96 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  54.96 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  49.25 
 
 		 136 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  55.73 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  49.22 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  50.75 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  51.94 
 
 		 137 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  52.76 
 
 		 137 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  64.18 
 
 		 136 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  49.21 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  47.29 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  51.59 
 
 		 142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  53.12 
 
 		 137 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  41.94 
 
 		 143 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  40.32 
 
 		 152 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  40.18 
 
 		 133 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  40 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  38.41 
 
 		 144 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  39.84 
 
 		 135 aa  91.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  40.65 
 
 		 137 aa  91.3  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  37.1 
 
 		 145 aa  89  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  40.77 
 
 		 137 aa  87.8  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40.94 
 
 		 127 aa  87.8  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  39.67 
 
 		 136 aa  87.8  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  40.95 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  38.97 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  38.97 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  38.97 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  42.52 
 
 		 130 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  40.94 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  42.15 
 
 		 133 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  39.55 
 
 		 160 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  39.55 
 
 		 160 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  42.19 
 
 		 131 aa  84.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  37.19 
 
 		 143 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  42.19 
 
 		 131 aa  84.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  42.19 
 
 		 131 aa  84.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  41.73 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  41.73 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  41.73 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  41.73 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  41.73 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  41.73 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  41.73 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  43.75 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  38.24 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  39.2 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  38.13 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  39.05 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  40 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  36.15 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  40 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  39.67 
 
 		 129 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  35.54 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  37.19 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.11 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  40.5 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  38.1 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  37.19 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  39.05 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  37.98 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  38.1 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  39.05 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  39.05 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  38.1 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.88 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>