More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1272 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
187 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  91.4 
 
 
187 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  91.4 
 
 
187 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  91.4 
 
 
187 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  90.86 
 
 
187 aa  339  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  89.25 
 
 
187 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  88.71 
 
 
187 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  68.85 
 
 
191 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  67.39 
 
 
187 aa  255  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  66.3 
 
 
187 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  63.24 
 
 
187 aa  248  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  66.3 
 
 
185 aa  241  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  58.38 
 
 
187 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  59.56 
 
 
188 aa  216  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  54.4 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  58.03 
 
 
193 aa  198  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  49.75 
 
 
204 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  44.33 
 
 
195 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  44.33 
 
 
200 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  45.41 
 
 
195 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  43.89 
 
 
190 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  43.41 
 
 
190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  42.93 
 
 
188 aa  134  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  46.77 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  44.15 
 
 
192 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  46.77 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  45.88 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  40.76 
 
 
188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  40.76 
 
 
188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  40.76 
 
 
188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  40.76 
 
 
188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  40.76 
 
 
188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  40.66 
 
 
188 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  40.66 
 
 
188 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  40.66 
 
 
188 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  40.66 
 
 
188 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  41.49 
 
 
199 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  40.66 
 
 
188 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  40.66 
 
 
188 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  40.66 
 
 
188 aa  121  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  40.11 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  37.43 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 
189 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  38.37 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  35 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  36 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  30.37 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.73 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  37.68 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  35.57 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.81 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  44.57 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  36.42 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.47 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 
209 aa  67  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  31.15 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.99 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.99 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.99 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.99 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.84 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  32.87 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.87 
 
 
389 aa  65.1  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  24.88 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>