More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1066 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
747 aa  1496    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  46.28 
 
 
740 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 
747 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  41 
 
 
1827 aa  430  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  42.49 
 
 
523 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
578 aa  361  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  39.74 
 
 
648 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  40.99 
 
 
608 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  43.79 
 
 
574 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 
615 aa  342  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  40.77 
 
 
577 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
620 aa  326  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.7 
 
 
620 aa  323  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.49 
 
 
626 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 
767 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  36.14 
 
 
615 aa  310  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.67 
 
 
703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
955 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
935 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.75 
 
 
626 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.75 
 
 
614 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.47 
 
 
626 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.75 
 
 
614 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
614 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
636 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
612 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
614 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
520 aa  290  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
637 aa  289  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
662 aa  283  9e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  36.77 
 
 
653 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 
653 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
1450 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 
639 aa  281  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 
611 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.43 
 
 
714 aa  277  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.38 
 
 
714 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 
635 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 
635 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.42 
 
 
3145 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
688 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
1038 aa  273  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
542 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
602 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 
592 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 
601 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.56 
 
 
1034 aa  251  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  29.4 
 
 
1077 aa  251  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 
457 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 
1005 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.72 
 
 
760 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  43.81 
 
 
387 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 
529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  36.65 
 
 
556 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
637 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
607 aa  238  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.09 
 
 
604 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 
780 aa  236  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
681 aa  234  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 
472 aa  233  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
646 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
649 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
649 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 
527 aa  230  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  36.02 
 
 
1677 aa  230  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
607 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
636 aa  229  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.08 
 
 
454 aa  225  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
412 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.48 
 
 
473 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 
545 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  33.47 
 
 
546 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
484 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  34.13 
 
 
389 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
438 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  36.9 
 
 
872 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.77 
 
 
1764 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
1276 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
545 aa  213  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
1451 aa  210  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  38.69 
 
 
360 aa  210  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
1454 aa  210  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 
611 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.21 
 
 
503 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 
1212 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  35.52 
 
 
1073 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  35.25 
 
 
600 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
496 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
573 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  37.84 
 
 
385 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
571 aa  204  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  29 
 
 
630 aa  204  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 
545 aa  202  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
558 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 
505 aa  200  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  33.27 
 
 
540 aa  200  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  32.17 
 
 
705 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>