60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0989 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1630    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  43.53 
 
 
768 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  39.41 
 
 
726 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  41.25 
 
 
733 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  31.91 
 
 
815 aa  217  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  34.53 
 
 
740 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  34.08 
 
 
802 aa  200  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  34.48 
 
 
882 aa  190  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  33.49 
 
 
720 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  40.08 
 
 
800 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  34.85 
 
 
530 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  34.08 
 
 
539 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  41.84 
 
 
802 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  40.42 
 
 
802 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  40.42 
 
 
769 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  40.42 
 
 
769 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.38 
 
 
462 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  40.65 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  31.34 
 
 
577 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  31.34 
 
 
577 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  31.34 
 
 
577 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  29.77 
 
 
299 aa  107  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  33.49 
 
 
753 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  33.49 
 
 
753 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  34.62 
 
 
764 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  26.94 
 
 
670 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  33.52 
 
 
764 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  32.39 
 
 
963 aa  71.6  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  31.87 
 
 
969 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  31.71 
 
 
1118 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  35.26 
 
 
675 aa  67  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  31.07 
 
 
960 aa  67.4  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  29.65 
 
 
453 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  30.23 
 
 
436 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  33.12 
 
 
686 aa  64.3  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  33.78 
 
 
435 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  30.19 
 
 
615 aa  62  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  28.74 
 
 
436 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  29.27 
 
 
522 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  28.87 
 
 
494 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  30.57 
 
 
1892 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  29.03 
 
 
485 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.4 
 
 
1338 aa  56.6  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  29.17 
 
 
514 aa  54.3  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  24.3 
 
 
503 aa  54.3  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  26.92 
 
 
407 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  26.92 
 
 
407 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  24.45 
 
 
424 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  26.9 
 
 
698 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  26.57 
 
 
393 aa  52  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  26.83 
 
 
513 aa  52  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  28.46 
 
 
406 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  30.71 
 
 
523 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  33.63 
 
 
721 aa  48.9  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  34.29 
 
 
306 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  31.25 
 
 
777 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  23.37 
 
 
427 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  27.83 
 
 
746 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  25.13 
 
 
341 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  24.26 
 
 
420 aa  45.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>