154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0974 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  87.08 
 
 
358 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  81.74 
 
 
357 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  73.13 
 
 
361 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  73.13 
 
 
361 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  73.13 
 
 
361 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  72.84 
 
 
361 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  72.84 
 
 
361 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  72.84 
 
 
361 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  68.44 
 
 
370 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  70.33 
 
 
361 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  65.28 
 
 
362 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  62.39 
 
 
358 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  58.81 
 
 
346 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  56.92 
 
 
353 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  56 
 
 
353 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  56.6 
 
 
349 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  55.66 
 
 
349 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  55.66 
 
 
349 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  55.66 
 
 
349 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  51.68 
 
 
331 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  51.68 
 
 
331 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  51.07 
 
 
331 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  52.77 
 
 
352 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  51.77 
 
 
311 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  44.38 
 
 
341 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  44.38 
 
 
341 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  44.06 
 
 
341 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  40.06 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  42.63 
 
 
337 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  38.82 
 
 
366 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  38.44 
 
 
357 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  40.52 
 
 
328 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  39.2 
 
 
348 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  39.81 
 
 
388 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  39.2 
 
 
348 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  41.88 
 
 
427 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  36.55 
 
 
349 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  39.88 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  39.21 
 
 
359 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  37.5 
 
 
488 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  41.29 
 
 
336 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  39.21 
 
 
377 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  32.83 
 
 
356 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  33.73 
 
 
356 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  33.73 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.84 
 
 
349 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  32.83 
 
 
356 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  33.43 
 
 
356 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  35.39 
 
 
385 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  31.68 
 
 
330 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  29.65 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.85 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  45.83 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  45.83 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  45.83 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  45.83 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  45.83 
 
 
481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  45.83 
 
 
492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.18 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  28.33 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  33.76 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  28.57 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  29.49 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  33.44 
 
 
332 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  26.14 
 
 
332 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  24.84 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  24.84 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  28.89 
 
 
366 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  28.29 
 
 
366 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  31.4 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.44 
 
 
332 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  27.73 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  28.89 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  28.89 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  28.29 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  28.89 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  28.89 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  28.89 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  28.89 
 
 
366 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  27.93 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  28.01 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  27.27 
 
 
327 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.14 
 
 
364 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  26.99 
 
 
327 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  26.99 
 
 
327 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  28.9 
 
 
338 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.98 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.98 
 
 
332 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  26.92 
 
 
363 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  28.14 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  28.84 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.43 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  28.18 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  25.32 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  26.27 
 
 
354 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  24.69 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  26.05 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  24.69 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  25.16 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>