66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0960 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  65 
 
 
184 aa  248  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  46.41 
 
 
184 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  43.24 
 
 
186 aa  131  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  39.01 
 
 
190 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.26 
 
 
220 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  37.42 
 
 
179 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.75 
 
 
186 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  33.52 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  36.59 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  35.11 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  31.65 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  31.94 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  30.13 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  31.94 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  31.94 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  29.45 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  31.94 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.92 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  32.64 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.82 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
172 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  31.85 
 
 
187 aa  57.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 
229 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  29.71 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.89 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  29.56 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  31.01 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  25.47 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.81 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  28.02 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  30.52 
 
 
193 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  28.26 
 
 
177 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 
191 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  27.27 
 
 
188 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  26.47 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  28.08 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  21.88 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  28.71 
 
 
213 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  28.25 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.33 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  24.32 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  24.22 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  26.67 
 
 
180 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.51 
 
 
191 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>