92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0852 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0296  carbohydrate porin  79.72 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2652  carbohydrate porin  79.72 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.486905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0309  carbohydrate porin  79.72 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3503  carbohydrate-selective porin OprB  90.63 
 
 		 514 aa  854    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0267  carbohydrate porin  79.58 
 
 		 514 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0852  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 495 aa  1002    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4236  carbohydrate-selective porin OprB  87.68 
 
 		 492 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.269576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5422  carbohydrate-selective porin OprB  91.04 
 
 		 493 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585602  normal  0.389505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4759  carbohydrate-selective porin OprB  88.28 
 
 		 494 aa  865    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.15964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0489  carbohydrate porin  79.72 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4863  carbohydrate-selective porin OprB  90.63 
 
 		 514 aa  854    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3354  carbohydrate porin  79.72 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3023  carbohydrate porin  79.72 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2070  carbohydrate porin  79.72 
 
 		 504 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3953  carbohydrate-selective porin OprB  58.28 
 
 		 488 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268403  normal  0.112791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4831  Carbohydrate-selective porin OprB  55.56 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0156749  normal  0.100608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1832  carbohydrate porin  54.93 
 
 		 474 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.378247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4004  carbohydrate-selective porin OprB  57.77 
 
 		 483 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2528  Carbohydrate-selective porin OprB  48.9 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.310329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3558  carbohydrate-selective porin OprB  41.75 
 
 		 534 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2156  carbohydrate-selective porin OprB  47.33 
 
 		 478 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4737  Carbohydrate-selective porin OprB  36.82 
 
 		 502 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0100904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4227  carbohydrate-selective porin OprB  37.79 
 
 		 498 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796044  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2771  carbohydrate-selective porin OprB  37.58 
 
 		 534 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2998  Carbohydrate-selective porin OprB  37.37 
 
 		 534 aa  299  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2894  Carbohydrate-selective porin OprB  38.41 
 
 		 509 aa  299  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0870  carbohydrate-selective porin OprB  38.14 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  hitchhiker  0.00100235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1380  Carbohydrate-selective porin OprB  37.32 
 
 		 522 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.768391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0904  Carbohydrate-selective porin OprB  38.15 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0673705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1384  carbohydrate-selective porin OprB  36.96 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1659  Carbohydrate-selective porin OprB  36.96 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2969  carbohydrate-selective porin OprB  36.5 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1762  Carbohydrate-selective porin OprB  36.3 
 
 		 446 aa  266  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1735  carbohydrate-selective porin OprB  36.32 
 
 		 449 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0819299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1063  Carbohydrate-selective porin OprB  34.45 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.659002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3629  carbohydrate-selective porin OprB  36.07 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419401  decreased coverage  0.00176786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1597  carbohydrate-selective porin OprB  31.88 
 
 		 480 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0966255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2204  carbohydrate-selective porin OprB  28.09 
 
 		 422 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3570  carbohydrate-selective porin OprB  28.24 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2957  carbohydrate-selective porin OprB  28.01 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  normal  0.40455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2351  carbohydrate-selective porin OprB  27.19 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.348926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1331  carbohydrate-selective porin OprB  28.64 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.901069  hitchhiker  0.00588319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2711  carbohydrate-selective porin OprB  27.4 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.695739  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5436  carbohydrate-selective porin, OprB family  27.66 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390026  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2950  glucose-sensitive porin  27.6 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.393124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34960  glucose-sensitive porin  27.18 
 
 		 452 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000209451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3070  carbohydrate-selective porin OprB  26.82 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.681986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2838  carbohydrate-selective porin OprB  26.82 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1632  putative porin B precursor outer (glucose porin) transmembrane protein  30.37 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4912  Carbohydrate-selective porin OprB  29.59 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00363735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3835  Carbohydrate-selective porin OprB  29.59 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.899229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1117  carbohydrate-selective porin OprB  25.1 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00415727  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1057  carbohydrate-selective porin OprB  27 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2860  carbohydrate-selective porin OprB  26.61 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00385913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1019  porin B  26.83 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4200  Carbohydrate-selective porin OprB  29.98 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1943  outer membrane porin OprB precursor  27.11 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4205  carbohydrate-selective porin OprB  26.49 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23030  glucose/carbohydrate outer membrane porin OprB precursor  26.67 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0211738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1017  carbohydrate-selective porin OprB  26.32 
 
 		 447 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1296  porin B  24.02 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1082  carbohydrate-selective porin OprB  25.62 
 
 		 448 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0774059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1445  porin B  26.02 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.374886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4360  carbohydrate-selective porin OprB  25.79 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.195321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4366  carbohydrate-selective porin OprB  25.99 
 
 		 448 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00370105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4276  carbohydrate-selective porin OprB  25.62 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1190  Carbohydrate-selective porin OprB  26.25 
 
 		 501 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4576  carbohydrate-selective porin OprB  24.72 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2150  Carbohydrate-selective porin OprB  27.25 
 
 		 418 aa  101  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000322479  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2522  carbohydrate-selective porin, OprB family  27.25 
 
 		 418 aa  101  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0118751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0154  Carbohydrate-selective porin OprB  26.33 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.858222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01615  regulator of pathogenicity factors  23.5 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00130056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2178  carbohydrate-selective porin OprB  27.05 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278032  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4102  Carbohydrate-selective porin OprB  26.68 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.792226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1771  Carbohydrate-selective porin OprB  26.3 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.799068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1115  Carbohydrate-selective porin OprB  25 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.967056  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00490  regulator of pathogenicity factors  23.27 
 
 		 425 aa  66.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1821  Carbohydrate-selective porin OprB  22.64 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2033  Carbohydrate-selective porin OprB  24.4 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1477  Carbohydrate-selective porin OprB  24.95 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3047  carbohydrate-selective porin OprB  26.63 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.854363  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2250  carbohydrate-selective porin, OprB family  26.95 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1898  Carbohydrate-selective porin OprB  26.95 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.541333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1095  Carbohydrate-selective porin OprB  24.7 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0806614  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2869  Carbohydrate-selective porin OprB  21.92 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0854  Carbohydrate-selective porin OprB  23.61 
 
 		 485 aa  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.648225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3489  carbohydrate-selective porin OprB  22.75 
 
 		 493 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0812  carbohydrate-selective porin OprB  29.55 
 
 		 268 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3797  Carbohydrate-selective porin OprB  22.96 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3871  Carbohydrate-selective porin OprB  22.75 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0231495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10870  hypothetical protein  21.36 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00009778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1247  Carbohydrate-selective porin OprB  20.53 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>