22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0749 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0749  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  341  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3426  hypothetical protein  89.43 
 
 
124 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4942  hypothetical protein  89.43 
 
 
124 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140936  unclonable  0.0000158871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5346  hypothetical protein  91.89 
 
 
112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4399  hypothetical protein  83.33 
 
 
112 aa  196  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  46.81 
 
 
683 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0081  hypothetical protein  42.62 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.824718 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  51.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2694  putative cytochrome c family protein  36.59 
 
 
133 aa  44.3  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.97531  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0393  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789834  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  38.89 
 
 
388 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  38.89 
 
 
388 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  32.58 
 
 
259 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2607  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.33 
 
 
332 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00078494  normal  0.780558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  44.64 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
330 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  46.51 
 
 
644 aa  41.2  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  58.54 
 
 
111 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  44.44 
 
 
286 aa  41.2  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  37.78 
 
 
388 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  37.25 
 
 
393 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  33.8 
 
 
643 aa  40.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>