More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0395 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  78.34 
 
 
520 aa  769    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  90.45 
 
 
516 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3061  GntR family transcriptional regulator  76.11 
 
 
513 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908638  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  91.95 
 
 
502 aa  866    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  89.23 
 
 
501 aa  817    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
497 aa  972    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1229  GntR family transcriptional regulator  75.91 
 
 
513 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0515  GntR family transcriptional regulator  75.91 
 
 
513 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1424  GntR family transcriptional regulator  75.91 
 
 
513 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0638  GntR family transcriptional regulator  75.91 
 
 
513 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  92.15 
 
 
502 aa  871    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1456  GntR family transcriptional regulator  75.91 
 
 
513 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  91.26 
 
 
516 aa  854    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  92.15 
 
 
502 aa  871    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1558  GntR family transcriptional regulator  76.2 
 
 
499 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.66 
 
 
500 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
496 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
492 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
490 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
507 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
507 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  40.04 
 
 
507 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  40.97 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.05 
 
 
504 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  39.39 
 
 
507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
492 aa  303  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.32 
 
 
515 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
506 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
506 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
509 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 
470 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
506 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
506 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
506 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.9 
 
 
485 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
506 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  38.58 
 
 
511 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.9 
 
 
485 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
513 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
485 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
501 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
492 aa  294  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
569 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  41.53 
 
 
476 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
485 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.55 
 
 
501 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  39.92 
 
 
503 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
487 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 
503 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.75 
 
 
501 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
501 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
492 aa  289  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
501 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.59 
 
 
501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  40.48 
 
 
508 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
509 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  38.54 
 
 
523 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.15 
 
 
471 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
444 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  38.35 
 
 
521 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.31 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.31 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.32 
 
 
495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
491 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.3 
 
 
503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  37.03 
 
 
475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  36.05 
 
 
504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  39.5 
 
 
502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
504 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.42 
 
 
497 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  39.88 
 
 
509 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  38.89 
 
 
476 aa  282  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
564 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
546 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
564 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  38.93 
 
 
561 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
502 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
504 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  39.71 
 
 
498 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  39.29 
 
 
502 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 
470 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  37.73 
 
 
489 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.68 
 
 
488 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  36.1 
 
 
499 aa  280  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  38.57 
 
 
509 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.3 
 
 
488 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.7 
 
 
495 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  41.62 
 
 
506 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
473 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
496 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.76 
 
 
523 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>