More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0307 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  93.14 
 
 
627 aa  1163    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.95 
 
 
627 aa  1110    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.42 
 
 
623 aa  963    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
627 aa  1261    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.98 
 
 
631 aa  1179    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.38 
 
 
634 aa  1177    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  92.9 
 
 
638 aa  1171    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.38 
 
 
634 aa  1177    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  41.51 
 
 
616 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
628 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  38.84 
 
 
623 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  39.97 
 
 
659 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
672 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  40.25 
 
 
670 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  41.45 
 
 
626 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  41.45 
 
 
621 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  39.12 
 
 
626 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
637 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  41.44 
 
 
621 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  37.13 
 
 
618 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  40.33 
 
 
630 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
668 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  37.06 
 
 
666 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  36.83 
 
 
635 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  37.24 
 
 
633 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  35.99 
 
 
643 aa  350  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  38.04 
 
 
666 aa  349  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.9 
 
 
665 aa  345  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  39.32 
 
 
600 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
635 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
683 aa  339  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
634 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  40 
 
 
634 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
634 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
634 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  37.81 
 
 
635 aa  336  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  38.63 
 
 
677 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  38.63 
 
 
677 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  38.42 
 
 
669 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  39.19 
 
 
677 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
669 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
669 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  38.72 
 
 
638 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  39.2 
 
 
615 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  38.77 
 
 
597 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
635 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.79 
 
 
677 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  38.3 
 
 
669 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  38.95 
 
 
600 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  40.17 
 
 
611 aa  329  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  37.31 
 
 
590 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  37.54 
 
 
643 aa  326  9e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  37.38 
 
 
643 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  37.54 
 
 
643 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  38.73 
 
 
668 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  36.89 
 
 
667 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 
672 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
606 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  38.21 
 
 
645 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  33.11 
 
 
594 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
622 aa  317  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
677 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
591 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  38.27 
 
 
622 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  35.96 
 
 
604 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
604 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
652 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  35.69 
 
 
604 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  36.44 
 
 
617 aa  296  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  35.69 
 
 
604 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
604 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  35.64 
 
 
586 aa  296  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  35.5 
 
 
604 aa  296  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  34.04 
 
 
585 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  35.53 
 
 
588 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  35.85 
 
 
602 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  34.01 
 
 
620 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  37.33 
 
 
592 aa  290  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.6 
 
 
597 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  30.88 
 
 
601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
621 aa  286  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
621 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  34.73 
 
 
603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  34.69 
 
 
622 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
602 aa  281  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  35.15 
 
 
604 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  34.89 
 
 
612 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  34.13 
 
 
599 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  36.03 
 
 
615 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  32.19 
 
 
600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  34.07 
 
 
623 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  33.61 
 
 
600 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  33.57 
 
 
585 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  29.08 
 
 
613 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
603 aa  270  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  37.07 
 
 
591 aa  267  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
585 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  35.56 
 
 
630 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>