More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0225 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5311  porin  89.9 
 
 
386 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
383 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  89.12 
 
 
386 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  91.67 
 
 
384 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  85.75 
 
 
385 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  85.75 
 
 
385 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  85.49 
 
 
385 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  79.22 
 
 
422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  78.44 
 
 
382 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  78.18 
 
 
424 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  78.44 
 
 
382 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  71.98 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  70.74 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  68.29 
 
 
388 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  66.58 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  60.71 
 
 
387 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  54.78 
 
 
387 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  53.75 
 
 
387 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1502  porin, interruption-N  83.9 
 
 
278 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.77 
 
 
383 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.77 
 
 
383 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.19 
 
 
436 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.19 
 
 
386 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.19 
 
 
386 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.19 
 
 
386 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.19 
 
 
386 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.19 
 
 
386 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.77 
 
 
383 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.69 
 
 
436 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.02 
 
 
383 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  46.45 
 
 
383 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.83 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.94 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.07 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  46.21 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  47.07 
 
 
374 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  45.66 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  45.66 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  45.66 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  43.56 
 
 
391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  43.56 
 
 
409 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  43.56 
 
 
409 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  45.41 
 
 
379 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  46.45 
 
 
374 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  45.41 
 
 
379 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  46.45 
 
 
374 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  46.45 
 
 
374 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.04 
 
 
389 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  43.32 
 
 
380 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  46.19 
 
 
374 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  44.06 
 
 
380 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  43.81 
 
 
380 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44.47 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  44.47 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44.47 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  44.06 
 
 
380 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  45.34 
 
 
381 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.32 
 
 
380 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  44.22 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  44.22 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  44.22 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  43.81 
 
 
379 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  44.59 
 
 
363 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.22 
 
 
384 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  44.58 
 
 
390 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  44.09 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  44.81 
 
 
374 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.21 
 
 
376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.21 
 
 
376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.21 
 
 
376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  46.21 
 
 
376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  44.9 
 
 
362 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.42 
 
 
379 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  44.9 
 
 
362 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  44.9 
 
 
362 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  44.58 
 
 
390 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.92 
 
 
379 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.34 
 
 
389 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  43.6 
 
 
381 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.33 
 
 
380 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.24 
 
 
381 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  43.8 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  44.85 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  44.85 
 
 
372 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  42.86 
 
 
391 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  44.9 
 
 
391 aa  252  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  43.52 
 
 
390 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  42.4 
 
 
387 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.85 
 
 
389 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  44.5 
 
 
380 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  45.31 
 
 
390 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  44.96 
 
 
390 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  43.57 
 
 
409 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  44.24 
 
 
383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  44.79 
 
 
390 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  42.96 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  45.05 
 
 
390 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  45.05 
 
 
390 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.94 
 
 
383 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  44.25 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>