275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0017 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  96.81 
 
 		 282 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  96.1 
 
 		 286 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  96.1 
 
 		 344 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  94.33 
 
 		 282 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  93.97 
 
 		 282 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  93.97 
 
 		 282 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  82.62 
 
 		 282 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  82.62 
 
 		 282 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  82.62 
 
 		 282 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  82.62 
 
 		 282 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  82.62 
 
 		 282 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  81.21 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  82.18 
 
 		 275 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  74.82 
 
 		 282 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  73.76 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  75.53 
 
 		 290 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  63.02 
 
 		 279 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  61.01 
 
 		 279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  62.26 
 
 		 279 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  57.04 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  59.85 
 
 		 278 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  57.71 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  57.99 
 
 		 279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  56.23 
 
 		 282 aa  294  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  56.04 
 
 		 294 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  51.94 
 
 		 283 aa  284  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  52.3 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  55.51 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  52.67 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  52.31 
 
 		 283 aa  275  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  55.73 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  55.35 
 
 		 285 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  56.72 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  50.78 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  45.62 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  43.12 
 
 		 687 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  36.8 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  36.13 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  34.42 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  35.91 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  34.48 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  32.85 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  33.7 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.29 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  32.36 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  32.44 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  34.08 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  30.24 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.71 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  29.96 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.09 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.16 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  32.77 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  40.34 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  32.23 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  30.74 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  28.79 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  33.2 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  31.23 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  32.46 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  29.13 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  33.77 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  33.07 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.39 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.86 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  37.71 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  31.25 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  32.58 
 
 		 276 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  30.94 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.78 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  29.08 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  30.94 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  31.48 
 
 		 284 aa  92.4  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  33.93 
 
 		 361 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  29.44 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  36.31 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  33.61 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  35.55 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  26.87 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  30.94 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  32.35 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  34.44 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  27.37 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  32.35 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  29.6 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  34.9 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  32.77 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  29.82 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  27.42 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  30.32 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  34.48 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  35.36 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  30.43 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  38.67 
 
 		 337 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  32.55 
 
 		 337 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.24 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  38.76 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  35.71 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>