More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_AR0065 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  3.84652e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0044  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.5462e-13  normal  0.0504095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0042  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.19208e-10  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1373  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  8.80968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1988  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  4.80253e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0065  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  2.08338e-13  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0063  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  8.53208e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0061  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  3.86077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  3.57048e-07  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1986  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  5.34255e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2624  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  1.21359e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2622  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  8.673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0029  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  5.3193e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0028  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  3.9203e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0031  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.81726e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0093  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  9.8404e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0051  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.49028e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.75234e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.11677e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  3.14245e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2100  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.90087e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3213  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  1.04569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2483  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  1.21548e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2485  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  1.26526e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2537  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00245562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2539  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00809573  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0097  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  3.37615e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0095  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  5.70772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0026  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  1.57015e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.63741e-10  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.03047e-08  normal  0.241015 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.92747e-08  normal  0.233868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0025  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  2.96278e-07  hitchhiker  0.00778031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  1.28898e-06  normal  0.570463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  5.84224e-07  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_003295  RS04526  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  1.65609e-07  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.2811e-10  hitchhiker  0.00448856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0015  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  1.83317e-10  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.08915e-08  normal  0.346684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0057  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  3.45066e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.34013e-08  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_003295  RS04527  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  1.78572e-06  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  2.16886e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0031  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  3.47346e-10  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  3.9615e-11  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0049  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  6.56103e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0047  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  6.69443e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0052  tRNA-Glu  97.26 
 
 
76 bp  129  9e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0028  tRNA-Glu  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0945817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0026  tRNA-Glu  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.197245  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0028  tRNA-Glu  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0017  tRNA-Glu  96.77 
 
 
76 bp  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299641  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0045  tRNA-Glu  96.77 
 
 
76 bp  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510305  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0039  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0043  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0023  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0274454  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0019  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.39609  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0026  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0141321  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0040  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0070  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.198719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0068  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.196442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0062  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0065  tRNA-Glu  98.25 
 
 
76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.363336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0002  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0220588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0102  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  1.93498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  91.78 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  6.47027e-05  hitchhiker  1.06632e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0072  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0096  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00116613  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.54963e-10  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.0757e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.93448e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.0686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0076  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.1411e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0097  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121483  normal  0.112474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0098  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000377978  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0099  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000375203  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0101  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.1614e-06  normal  0.113768 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0102  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.00176e-06  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0095  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00314986  normal  0.201708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.82107e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.67651e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.2653e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.05777e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0085  tRNA-Glu  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>