298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_AR0047 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.832737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1702  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0590  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.532151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2759  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0341238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0034  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0024  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0039  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00372537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1501  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.287153  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1531  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1308  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.585322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0562  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.60431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0052  tRNA-Pro  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0039  tRNA-Pro  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0035  tRNA-Pro  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4244  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0047  tRNA-Pro  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0768  tRNA-Pro  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.28458  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0016  tRNA-Pro  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0711  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03760  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t08  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.657243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0050  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0840957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  92.65 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0007  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1654  tRNA-OTHER  100 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000253877  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4311  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0002  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0041  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0010  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.475805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0047  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  92.19 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0065  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000795587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0053  tRNA-OTHER  95.65 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0041  tRNA-Pro  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0026  tRNA-Pro  94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00524532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0027  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00246876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0034  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.155615  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0016  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0141  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.122826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0144  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0130  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0142  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0046  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000453767  hitchhiker  0.0000828502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0048  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000100606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t001  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0021  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000217303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0022  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00039101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0087  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0123  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0167093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0038  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000899293  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPro01  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000413507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPro02  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00984668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0017  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0103  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727228  decreased coverage  0.000000214334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0122  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00712397  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0027  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0028  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00514358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t107  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t098  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000663033  normal  0.0932756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0142  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0143  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00160739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3155t  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01261  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00489  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3099t  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000107843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00487  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3101t  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0056  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0031  tRNA-Pro  89.06 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0023  tRNA-Pro  89.06 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.247258  normal  0.475897 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0063  tRNA-Pro  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0067  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>