21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6207 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  100 
 
 
475 aa  984    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  34.29 
 
 
624 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  34.29 
 
 
624 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  34.29 
 
 
624 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  34.29 
 
 
624 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  34.29 
 
 
624 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  34.29 
 
 
624 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  21.39 
 
 
616 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  21.74 
 
 
645 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  23.97 
 
 
572 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  22.46 
 
 
741 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  25.93 
 
 
707 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0071  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.41 
 
 
700 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  24.44 
 
 
717 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2022  phage integrase  25.35 
 
 
650 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  22.84 
 
 
600 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  22.84 
 
 
600 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  24.39 
 
 
693 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  23.3 
 
 
709 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  22.83 
 
 
714 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  21.93 
 
 
713 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>