232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6160 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 298 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  97.32 
 
 		 298 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  97.32 
 
 		 298 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  97.32 
 
 		 298 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  97.32 
 
 		 298 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  92.95 
 
 		 298 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  93.96 
 
 		 339 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  93.29 
 
 		 336 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  90.94 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  84.9 
 
 		 302 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  84.98 
 
 		 302 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  84.62 
 
 		 303 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  77.55 
 
 		 296 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  77.55 
 
 		 296 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  75.17 
 
 		 294 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  76.45 
 
 		 295 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  75.43 
 
 		 293 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  76.37 
 
 		 295 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  76.19 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  73.29 
 
 		 313 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  63.18 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  60.61 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  60.61 
 
 		 299 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  60.74 
 
 		 299 aa  324  9e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  54.08 
 
 		 299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  58.33 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.75 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  57.44 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  58.54 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  57.64 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  58.19 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  52.53 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  53.66 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  51.02 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  50.51 
 
 		 311 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  48.81 
 
 		 315 aa  265  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  51.7 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  50.53 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  46.27 
 
 		 325 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  45.98 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  49.45 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  50.52 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  46.37 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  48.16 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  44.63 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  43.58 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  45.39 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  49.28 
 
 		 640 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  41.99 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  41.99 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.55 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  43.64 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  44.24 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.55 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.24 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  45.55 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.39 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  40.5 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 363 aa  172  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.38 
 
 		 584 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  38.95 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  57.14 
 
 		 120 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  29.61 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  29.61 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1973  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.12 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  24.67 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  25.19 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  25.66 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  28.64 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  26.24 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  28.5 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  29.82 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  28.47 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  29.82 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  29.96 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  29.96 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>