More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5809 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
546 aa  1135    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
502 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  36.13 
 
 
502 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 
502 aa  339  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 
714 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.84 
 
 
714 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.35 
 
 
473 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 
472 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
556 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
646 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
649 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
649 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 
1034 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
1005 aa  246  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
592 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 
601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.42 
 
 
1077 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
1038 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  32.29 
 
 
603 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 
602 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.03 
 
 
760 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
1450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
3145 aa  230  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.52 
 
 
653 aa  228  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
653 aa  228  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
1827 aa  228  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 
637 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
681 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
688 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
615 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  29.49 
 
 
703 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
780 aa  217  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
767 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.77 
 
 
1677 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
574 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
578 aa  213  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.25 
 
 
577 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
583 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
608 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.19 
 
 
620 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 
648 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
620 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.8 
 
 
689 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1212 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
457 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
558 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.83 
 
 
1764 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
662 aa  194  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  27.76 
 
 
540 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
935 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
520 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
955 aa  193  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 
740 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
747 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  29.42 
 
 
505 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  29.53 
 
 
630 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 
604 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
523 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 
550 aa  187  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
529 aa  187  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 
595 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
406 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.84 
 
 
626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
614 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 
626 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 
614 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.71 
 
 
626 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 
614 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
614 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
614 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
612 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
636 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
559 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
639 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
607 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  31.22 
 
 
546 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.83 
 
 
503 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
607 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
484 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
1451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7048  hypothetical protein  31.02 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0796926 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
1454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
923 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
412 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.5 
 
 
545 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
496 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  29.18 
 
 
600 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  30.86 
 
 
389 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
636 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
588 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
573 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
545 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
611 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
545 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
611 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>