194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5759 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  46.71 
 
 		 786 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  65.88 
 
 		 766 aa  974    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  66.4 
 
 		 803 aa  984    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  57.11 
 
 		 794 aa  855    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 785 aa  1558    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  67.02 
 
 		 842 aa  987    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  61.65 
 
 		 849 aa  912    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  84.74 
 
 		 748 aa  1270    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  65.88 
 
 		 766 aa  974    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  66.01 
 
 		 984 aa  975    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  66.27 
 
 		 766 aa  980    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  66.58 
 
 		 766 aa  981    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  66.01 
 
 		 766 aa  975    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  85.33 
 
 		 816 aa  1244    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.09 
 
 		 775 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  38.04 
 
 		 783 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.98 
 
 		 797 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.52 
 
 		 797 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.39 
 
 		 834 aa  395  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.62 
 
 		 765 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.02 
 
 		 781 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.18 
 
 		 808 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  34.92 
 
 		 790 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.11 
 
 		 807 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  35.11 
 
 		 814 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.45 
 
 		 794 aa  376  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  34.48 
 
 		 790 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.71 
 
 		 782 aa  363  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  34.82 
 
 		 766 aa  360  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.33 
 
 		 789 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  34.68 
 
 		 803 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.91 
 
 		 788 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  34.79 
 
 		 810 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  34.79 
 
 		 782 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  34.79 
 
 		 803 aa  350  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  34.47 
 
 		 803 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.47 
 
 		 786 aa  350  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  31.08 
 
 		 815 aa  336  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.08 
 
 		 815 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  31.08 
 
 		 815 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.73 
 
 		 790 aa  320  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  30.79 
 
 		 754 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.9 
 
 		 791 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.24 
 
 		 778 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.16 
 
 		 798 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  29.18 
 
 		 788 aa  241  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  29.18 
 
 		 765 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  28.43 
 
 		 804 aa  224  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  25.52 
 
 		 834 aa  157  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.34 
 
 		 778 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.36 
 
 		 734 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.87 
 
 		 778 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.4 
 
 		 778 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.26 
 
 		 852 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.36 
 
 		 866 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  25.53 
 
 		 839 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  24.66 
 
 		 853 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  24.66 
 
 		 853 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  24.73 
 
 		 853 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.94 
 
 		 828 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  24.62 
 
 		 853 aa  75.1  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  24.33 
 
 		 853 aa  74.3  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.83 
 
 		 832 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.92 
 
 		 840 aa  72  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  35.22 
 
 		 913 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.21 
 
 		 823 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  35.22 
 
 		 914 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  35.22 
 
 		 914 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  31.35 
 
 		 939 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.27 
 
 		 870 aa  68.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  22.9 
 
 		 828 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  23.27 
 
 		 870 aa  68.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  22.9 
 
 		 828 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.775864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  30 
 
 		 838 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30 
 
 		 838 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  30 
 
 		 838 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  30 
 
 		 838 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.86 
 
 		 876 aa  67.4  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  30 
 
 		 838 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.41 
 
 		 838 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  29.41 
 
 		 863 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  22.77 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  23.74 
 
 		 823 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  23.74 
 
 		 823 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.53 
 
 		 886 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.03 
 
 		 837 aa  63.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.97 
 
 		 853 aa  62  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.05 
 
 		 857 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.99 
 
 		 844 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  29.79 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.11 
 
 		 875 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.11 
 
 		 875 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.24 
 
 		 963 aa  60.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.32 
 
 		 930 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.05 
 
 		 831 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.13 
 
 		 864 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4579  CshB porin  34.33 
 
 		 812 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.363192 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.32 
 
 		 884 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.89 
 
 		 856 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  22.89 
 
 		 872 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>