50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5640 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  100 
 
 
761 aa  1568  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  8.85028e-09  normal 
 
 
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  32.37 
 
 
725 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  30.3 
 
 
695 aa  176  1e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  29.68 
 
 
744 aa  168  3e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  28.46 
 
 
736 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  27.43 
 
 
739 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  29.95 
 
 
509 aa  157  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  31.63 
 
 
413 aa  155  3e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  30.33 
 
 
835 aa  143  1e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  33.83 
 
 
818 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  28.06 
 
 
476 aa  129  1e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  27.19 
 
 
896 aa  127  8e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  28.08 
 
 
815 aa  121  5e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  28.08 
 
 
815 aa  121  5e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  28.5 
 
 
489 aa  121  5e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  30.15 
 
 
789 aa  119  2e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  27.04 
 
 
806 aa  117  7e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  33.6 
 
 
781 aa  116  1e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.96901e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  26.99 
 
 
736 aa  114  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  28.7 
 
 
697 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  27.91 
 
 
662 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  30.88 
 
 
789 aa  108  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  26.62 
 
 
788 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.9982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  26.62 
 
 
788 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  27.21 
 
 
892 aa  94.7  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  26.79 
 
 
812 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  27.91 
 
 
778 aa  86.3  2e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  26.26 
 
 
431 aa  76.6  2e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  28.39 
 
 
400 aa  71.2  6e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  29.22 
 
 
541 aa  68.6  4e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  40.57 
 
 
695 aa  65.9  3e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  29.03 
 
 
748 aa  62.8  2e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  26.94 
 
 
749 aa  60.1  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  30.07 
 
 
795 aa  58.2  5e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0544  hypothetical protein  23.84 
 
 
543 aa  57.8  8e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000201357  normal  0.0617136 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  28.39 
 
 
778 aa  57.4  9e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  39.02 
 
 
734 aa  56.6  2e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  26.8 
 
 
796 aa  54.7  7e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  26.83 
 
 
920 aa  54.3  8e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  29.01 
 
 
785 aa  53.5  1e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  34.95 
 
 
751 aa  52.4  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0934  hypothetical protein  28.41 
 
 
181 aa  51.6  5e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  27.04 
 
 
799 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 
794 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  29.53 
 
 
815 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  25.13 
 
 
925 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 
768 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 
813 aa  45.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 
813 aa  45.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  25 
 
 
998 aa  44.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>