164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5527 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  75.92 
 
 
243 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  71.49 
 
 
226 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  73.79 
 
 
243 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  73.79 
 
 
243 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  72.29 
 
 
226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  71.26 
 
 
245 aa  238  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  46.51 
 
 
248 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  50.41 
 
 
245 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  43.41 
 
 
248 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  45.56 
 
 
246 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  45.56 
 
 
246 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  45.56 
 
 
246 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  45.89 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  45.89 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  51.63 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  44.57 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  41.94 
 
 
245 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  56.18 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  44.83 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  38.95 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  41.56 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  39.74 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  35.78 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.97 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  38.54 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  44.16 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  35.34 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  44.44 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  42.68 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  33.05 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.98 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  38.89 
 
 
293 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  39.33 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.3 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.3 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  40.51 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  34.29 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  40 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  39.24 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  37.5 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  37.97 
 
 
280 aa  62  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  37.97 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  33.63 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  35.44 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  36.36 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  30.38 
 
 
287 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.9 
 
 
233 aa  58.9  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  29.05 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  35.9 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  43.04 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  43.04 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  35.9 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  36.36 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  34.62 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  40 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  30.72 
 
 
269 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  38.46 
 
 
317 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  30.06 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  32.7 
 
 
271 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  36.36 
 
 
276 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  30 
 
 
292 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.08 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  33.85 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.8 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  33.11 
 
 
193 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  35.06 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  35.96 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  35.06 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  38.67 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  28.68 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  34.23 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  34.23 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  38.27 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  26.81 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  35.06 
 
 
273 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  45.71 
 
 
114 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  36.3 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  32.54 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.86 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  32.74 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  32.74 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  33.88 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  32.74 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  38.67 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  48 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  38.67 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  28.89 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  33.77 
 
 
117 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.73 
 
 
285 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  39.51 
 
 
228 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  32.05 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32.47 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  34.15 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  46.94 
 
 
308 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  31.17 
 
 
274 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  46 
 
 
274 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  32.05 
 
 
286 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  35.8 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  32.47 
 
 
472 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>