28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5272 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  68.06 
 
 
283 aa  348  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  67.49 
 
 
272 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  57.36 
 
 
283 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  54.69 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  32.95 
 
 
259 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  38.57 
 
 
265 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  38.57 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  37 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  37.88 
 
 
313 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.82 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  39.9 
 
 
259 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  30.35 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  36.67 
 
 
270 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  32.93 
 
 
248 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  30.69 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  23.46 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  24.52 
 
 
241 aa  48.9  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  28.46 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  23.72 
 
 
271 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.71 
 
 
268 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  30.95 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.21 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  30.95 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  22.22 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  25.66 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  28.7 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  33.5 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>